菌种鉴定是指通过DNA测序和遗传进化角度序阐明微生物种群之间的进化关系,确认菌种身份的研究方法。通过Gene Bank数据库搜库比对,鉴定结果一般可以鉴定到种,比传统生化鉴定更为先进、快速、准确
技术路线
样品准备→基因组DNA提取→PCR扩增和产物纯化→上机测序→生信分析
技术优势
1. DNA测序不依赖菌种本身特点,对所有菌株均可使用;2. 项目周期短,报告内容丰富,提供blast比对结果
送样要求:
致病菌需提前告知,并明确来源;
2. 新鲜菌液≥400μl,平板菌保证上有分离的单菌落,低温运输;
3. 基因组:浓度≥ 10ng/ul,总体积≥50ul,电泳有明显主带,低温运输。