宏基因组(Metagenome)测序是指对所有微生物基因组总和进行高通量测序,结合生物信息学手段分析特定环境中微生物群体物种信息、功能基因信息以及与环境间的相互作用关系的一种研究方法。摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制,提取环境中总DNA进行研究,可以全面的分析微生物的物种、基因组成已广泛应用于微生物领域。
技术路线
样品准备→DNA提取→文库构建→上机测序→数据质控→生信分析
技术优势
※无需分离纯培养微生物,直接对特定环境中微生物群体进行测序
※采用高通量测序技术,实验周期短,数据质量告
※斯坦德集团拥有蛋白质组学、代谢组学的分析技术,可联合多组学整合分析提升文章质量
送样要求:
环境样本:土壤≥10g,粪便≥5g,污泥/沉积物≥10g,血液≥20mL,水体-滤膜过滤至有可见覆盖物。
DNA:总量≥3μg,浓度≥30ng/μL,DNA无降解,无污染
储存运输:干冰运输(干冰挥发每天以5公斤计算,请保证充足的干冰量)